于2019年4月在福建省三沙湾海域24个站位进行浮游植物采样调查，对浮游植物种类组成、优势种群、细胞密度及生态学指数进行初步研究，结果表明三沙湾海域共鉴定浮游植物4门69属181种，其中硅藻门57属161种、甲藻门10属16种、蓝藻门1属3种、金藻门1属1种；优势种有具槽帕拉藻（Paralia sulcata）、中肋骨条藻（Skeletonema costatum）、菱形海线藻（Thalassionema nitzschioides）、琼氏圆筛藻（Coscinodiscus jonesianus）和菱形藻（Nitzschia sp.）；浮游植物细胞密度为中层＞底层＞表层，水平分布中各站位有较大差异，密度介于（9.20~38.9）×106 个/m3之间，平均值为22.67×106 个/m3；不同站位丰富度指数介于0.77~1.83之间，平均值为1.24；均匀度指数介于0.35~0.74之间，平均值为0.63；多样性指数介于1.14~2.63之间，平均值为2.13，总体评价处于中等水平。

根据2009至2018年三沙湾海水增养殖区水质、沉积物和养殖生物监测数据，按照环境质量综合指数法评价三沙湾海水增养殖区环境质量综合状况。结果发现，近十年三沙湾海水增养殖区环境质量综合状况呈现稳中有升的趋势，2009年环境质量等级仅为及格，个别时段不能满足功能区环境质量要求；2010至2012年转为较好，一般能满足功能区环境质量要求；2013年以来均为优良，能满足功能区环境质量要求，但2018年环境质量综合指数略有下降，这种变化趋势与近年来三沙湾水产养殖业、临港工业的发展和海洋环境保护的力度存在一定的关系。通过分析评价近十年来三沙湾海水增养殖区环境质量综合状况，掌握养殖环境变化趋势，为渔业水域环境保护提供依据。